Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd5Q9CQP3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd5Q9CQP3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Chchd5Q9CQP3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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