Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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