Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB13Q92826 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms