Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Dnajc28Q8VCE1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnajc28Q8VCE1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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