Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms