Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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