Protein–RNA interactions for Protein: Q80W14

Prpf40b, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40bQ80W14 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Prpf40bQ80W14 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Prpf40bQ80W14 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Prpf40bQ80W14 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf40bQ80W14 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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