Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccp110Q7TSH4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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