Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms