Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atp8b3Q6UQ17 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atp8b3Q6UQ17 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Atp8b3Q6UQ17 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Atp8b3Q6UQ17 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Atp8b3Q6UQ17 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms