Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf8Q6DID3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms