Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms