Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxn3Q499D0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms