Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms