Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm1123Q1RME4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm1123Q1RME4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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