Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnma1Q08460 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnma1Q08460 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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