Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms