Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F13bQ07968 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms