Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms