Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf5P70191 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms