Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms