Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms