Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps33bP59016 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps33bP59016 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps33bP59016 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps33bP59016 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps33bP59016 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps33bP59016 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps33bP59016 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms