Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf5P56477 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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