Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms