Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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