Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BrafP28028 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BrafP28028 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BrafP28028 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BrafP28028 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BrafP28028 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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