Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NdnP25233 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NdnP25233 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms