Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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