Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ComtO88587 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms