Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms