Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rgs9O54828 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms