Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp17lcG5E8I7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp17lcG5E8I7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp17lcG5E8I7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp17lcG5E8I7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp17lcG5E8I7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17lcG5E8I7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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