Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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