Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms