Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Plekhd1B2RPU2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plekhd1B2RPU2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms