Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S1pr4Q9Z0L1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms