Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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