Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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