Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nop56Q9D6Z1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nop56Q9D6Z1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nop56Q9D6Z1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nop56Q9D6Z1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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