Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PudpQ9D5U5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PudpQ9D5U5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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