Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms