Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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