Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bap1Q99PU7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms