Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms