Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ell3Q80VR2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ell3Q80VR2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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