Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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