Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtss1lQ6P9S0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtss1lQ6P9S0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtss1lQ6P9S0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtss1lQ6P9S0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtss1lQ6P9S0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtss1lQ6P9S0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtss1lQ6P9S0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtss1lQ6P9S0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtss1lQ6P9S0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtss1lQ6P9S0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms