Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms