Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pram1Q6BCL1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms